Игра пересказывает события второй части основной серии. Хотя делает это весьма спорно: так, по версии Shaolin Monks Кунг Лао Был на первом турните замаскированным под война Шан Цзуна. Лю Канг, якобы, присутствовал при атаке врага на родной Шаолиньский храм, хотя каноничная биография персонажа специально делает ремарку: его там не было. Характеры героев сильно отличаются от того, что было принято по канону, да и вообще, о чем говорить, когда в Shaolin Monks были убиты Джейд, Рептилия, Барака, Кано, Шан Цзун и Кинтаро? Авторы просто забили на здравый смысл и достоверность.

Авторы планировали включить в игру режим выживания, но он не был закончен и так и не попал в финальную версию. Тем не менее, если выполнить длинную последовательность крайне неочевидных действий, к нему всё-таки можно получить доступ.