Изначально Джейсона Броди озвучивал Элиас Туфексис (Elias Toufexis). Он записывал реплики для Far Cry 3 два года, но после выхода Deus Ex: Human Revolution, где актёр сыграл Адама Дженсена, разработчики из Ubisoft решили отказаться от его услуг — слишком уж узнаваемый голос Элиаса вызывал бы у пользователей нежелательные ассоциации с главным героем Deus Ex. Туфексис в обиде не остался и признал, что замена была оправданна.

Во время рекламной кампании разработчики неоднократно упоминали комплексный и необычный сюжет, но после выхода критики единодушно признали, что обещание выполнено не было. Один из авторов игры Джеффри Йохалем (Jeffrey Yohalem) впоследствии заявил, что люди «не поняли фишки», и сценарий на самом деле полон мистики и загадок.

Незадолго до выхода игры разработчики выпустили специальное дополнение для MineCraft, в котором скопировали карту острова, добавили несколько видов оружия и ключевых персонажей. Кроме того, в модификации было заявлено 50 секретов для самых преданных фанатов.