Чужие в игре известны своей глупостью — они постоянно врезаются в стены и с трудом добираются до главного героя. Лишь спустя несколько лет после релиза Colonial Marines выяснилось, что отчасти проблема кроется в одной букве программного кода — в одной из строк вместо Tether написано Teather. Если убрать лишнюю A в конфигурационном файле, пришельцы станут гораздо менее бестолковыми.

В апреле SEGA признала, что рекламные трейлеры игры не отражали её реального качества и могли ввести игроков в заблуждение. Это произошло после того, как один из игроков обратился с жалобой в английское Агентство по рекламным стандартам. Теперь все трейлеры игры будут снабжены соответствующей пометкой.

Игра разрабатывается настолько долго, что авторы успели отменить разработку игры для Playstation 2.

После выхода игры стало очевидно, что что-то пошло не так. В феврале 2013-ого анонимный источник рассказал, что Gearbox, которая должна была разрабатывать игру, «распилила» бюджет и тайно направила финансирование на Borderlands 2. Aliens делала какая-то сторонняя студия.