С таким не сталкивался, но по идее, если чистка рееста не помогает — видимо не то чистишь. В придачу, смотря какие папки ты удалил, скорее всего патчи(моды) если они были, ставились отдельно самой игры, типа мод — это отдельная программа и файлы сохраняются в той папке а т.к. реест один, и возможно, почищен не в том месте, привязка осталась. Возможно в папке «мои документы» осталась попка с игрой которая и хранит сохранения. Ну или старые игры писались и устанавливались как-то по другому. Возможно, если это из лаунчера стим к примеру, у тебя стоит синхронизация сохранений, вот они при переустановке и подтягиваются. А возможно я несу бред :)
