Изначально Twilight Princess должна была стать сиквелом The Wind Waker — её рабочим названием было The Wind Waker 2. В TWW2 использовался бы тот же графический стиль, что и в первой части. Однако американское подразделение Nintendo сказало директору The Wind Waker Эйдзи Аонуме (Eiji Aonuma), что первая игра не слишком хорошо продалась в Америке из-за мультяшной внешности, которая создавала образ развлечения для детей. Тогда авторы приняли решение сделать более реалистичную «Зельду» и сменить подзаголовок.