Prince of Persia: Warrior Within отличается от первой игры наличием крови, расчлененки и бранной лексики, из-за чего имеет рейтинг “Mature”.

Восточная стилистика в игре практически не присутствует, а саундтрек состоит из метала и тяжелого рока от группы Godsmack, чья композиция “I Stand Alone” с одноименного сингла 2002-го года вошла в заглавный ролик.

В течение игры Принцу постоянно приходится путешествовать из прошлого в настоящее и наоборот с помощью специальных временных порталов. Пройти всю игру в одном времени невозможно. Например, в настоящем каменный мост, ведущий в крепость, разрушен, но в прошлом он цел.

При первом использовании каждого портала времени Принц получает новые способности в управлении временем и песками, схожие с аналогичными способностями в первой части игры. Также каждый раз при переходе через портал Принц восполняет запас Песков.

В течение игры можно найти до девяти мест увеличения максимума здоровья. Эти места сделаны по одному принципу. Вход в подобное место обычно замаскирован, если игрок находит этот вход, он попадает в коридор с множеством ловушек, пройдя который находит странную стену. Эти места не обязательны для посещения, можно пройти игру, не посетив ни одно из них. После посещения всех девяти пьедесталов можно получить удвоенную линейку здоровья.

Сохранить достижения в игре можно только в специальных местах с фонтанами, одновременно восстановив здоровье (в отличие от первой части).

В игре две концовки, зависящие от того, нашел ли игрок все девять пьедесталов здоровья или нет.

Несколько раз за игру встречаются эпизоды с Дахакой, где игроку необходимо убегать очень быстро, мгновенно ориентируясь на местности, поскольку, настигнув Принца, Дахака убивает его.

В игре можно найти секретное оружие вроде Перчатки Реймана, Хоккейной клюшки, Плюшевого мишки, Фламинго и Сияющего Меча.

Из-за возможности расчленять врагов и присутствия в игре бранной лексики, она имеет рейтинг «Mature» (17+). В некоторых европейских странах (в частности, в Германии) игра была издана без крови и расчлененки, в результате чего она стала доступна для более молодой аудитории.

Медальон Фары, который носит Принц, никак не мог быть в его руках, поскольку в конце первой части Принц снял его с себя, а после отмотки времени назад и закрытия Песочных Часов в финальной сцене игры видно, что Фара носила медальон на шее, следовательно, у Принца его не было. Вероятно, это ошибка сценаристов.

Медальон, очевидно, был создан на Острове Времени, вместе с Песками, Песочными Часами и Кинжалом. Это объясняет наличие совместимых с Медальоном пьедесталов, способных улучшать Медальон, увеличивая физическую выносливость носителя. Кроме того, становится понятным, почему Фара в первой части не превратилась в песочного монстра.

Песочные монстры созданы не случайно, как в первой части игры, а намеренно, они гораздо умнее обычных песочных зомби, активны, умеют выполнять акробатические приемы и разговаривать.

У Принца черные волосы, хотя в первой части игры они были темно-русые, но, что любопытно, в обеих частях в CG-роликах волосы Принца все равно были черными.

В разных частях серии Принца озвучивают разные актеры.

Если во время бегства от Дахаки активировать отмотку времени, то можно понять, о чем он говорит.

Дахака внешне напоминает выкрашенного в черный цвет Дьябло из одноименной компьютерной игры.

Похожая на браслет татуировка на левой руке Принца скопирована с татуировки одного из разработчиков.

Кайлину озвучивает итальянская актриса Моника Беллуччи.

В отличие от первой части, Принца озвучивает актер Робин Аткин Даунс.