Наносил термопасту тонким слоем на ЦП а на видеокарте чуть больше, т. к он не соприкасался к охлаждению.
Каждый раз, когда подобное слышу, сомневаюсь в своём многолетнем опыте возни с железом. Но всё же предположу, что
1. Либо вы как-то неправильно установили назад систему охлаждения (не до конца затянули винты крепёжной скобы?)
2. Либо ваш ноутбук до этого каким-то чудом работал и не сдох, если такая обстановка была с завода.
Вариант 2 возможен, если вместо термопасты там была термопрокладка, которую вы посчитали за что-то не столь важное и выкинули. Это само по себе странное решение для отвода тепла от ядра GPU, потому что теплопровдимость у неё хуже, чем у пасты, но в условиях зазора между компонентами больше 0.5мм иного выбора не остаётся. Конечно, можно ещё инженеров уволить, которые такое чудо собрали, но это рассуждение в никуда.
Однако, без модели ноутбука или, что лучше, фотографии радиатора, ничего конкретнее сказать нельзя.