В игре намеренно допущена географическая и хронологическая несообразность. Поскольку на карте показана лишь самая южная часть территории Мексики, то, чтобы сделать возможным прохождение квеста «Теночтитлан», расположение столицы ацтеков было сдвинуто далеко на юг, и город помещен на территорию современной Гватемалы. Кроме того, Теночтитлан выглядит все ещё как индейский город, хотя в середине XVII века он уже давно был перестроен испанцами.

После захвата «Синко Льягас», до выхода в море, можно увидеть в гавани второй «Синко Льягас», который будет просто стоять со спущенными парусами и с английскими флагами на мачтах.

Коллекционное издание игры было выпущено ограниченным тиражом в 3000 экземпляров. Счастливчики нашли внутри в частности аутентичную карту на ткани и зловещий амулет ацтеков.

Один из стартовых героев - Питер Блад. Для него подготовлено особенно начало, отсылающее нас к Рафаэлю Сабатини.

Изначально в игре планировались новые виды оружия - кастет и когти, но были вырезаны из-за ограничений движка.

В отличие от оригинала в игре появилось две новых больших локации. Это индейский город Теночтитлан и собственно сам Город потерянных кораблей.