Игру патчили всего один раз — в июле 2002 года.

Игра получила хорошие оценки — в среднем 80 из 100.

Владельцы прав на Duke Nukem: Manhattan Project отказались продать их обратно 3D Realms.

Вместе с игрой поставляется редактор — PrismED, но энтузиазма среди игроков на создание уровней не хватило.

Всего в игре 24 уровня — 8 частей по 3 этапа.

Главный антагонист Дюка в игре — профессор Мек Морфикс.

Игра полностью двухмерная, хотя и отрисовывает все объекты в 3D.

Летом 2010 года 3D Realms выпустили игру на платформе Xbox LIVE Arcade.

Движок игры Prism3D.